- Biblioteka Główna (JO)
- Biuro Kształcenia Praktycznego i Rozwoju Kompetencji (AD)
- Centralne Laboratorium Agroekologiczne (JO)
- Centralne Laboratorium Aparaturowe (JO)
- Centralne Laboratorium Badawcze (JO)
- Centrum Informatyki (JO)
- Centrum Kultury Fizycznej i Sportu (JO)
- Centrum Kultury i Folkloru Wsi (JO)
- Centrum Nauczania Jezyków Obcych i Certyfikacji (JO)
- Dział Technologii Multimedialnych (AD)
- Instytut Biologicznych Podstaw Chorób Zwierząt (WMW)
- Instytut Biologicznych Podstaw Produkcji Zwierzęcej (WNoZiB)
- Instytut Genetyki, Hodowli i Biotechnologii Roślin (WA)
- Instytut Gleboznawstwa, Inżynierii i Kształtowania Środowiska (WA)
- Instytut Produkcji Ogrodniczej [03.2019-...] (WO)
- Instytut Żywienia Zwierząt i Bromatologii (WNoZiB)
- Jednostka Administracji (AD)
- Jednostka Instytutu Nauk Rolniczych w Zamościu (WB)
- Jednostka Międzywydziałowa (JO)
- Jednostka Wydziału Agrobioinżynierii (WA)
- Jednostka Wydziału Biologii Środowiskowej (WBŚ)
- Jednostka Wydziału Inżynierii Produkcji (WIP)
- Jednostka Wydziału Medycyny Weterynaryjnej (WMW)
- Jednostka Wydziału Nauk o Zwierzętach i Biogospodarki (WNoZiB)
- Jednostka Wydziału Nauk o Żywności i Biotechnologii (WBIOTECH)
- Jednostka Wydziału Ogrodniczego (WO)
- Jednostka Wydziału Rolniczego (WA)
- Katedra Analizy i Oceny Jakości Żywności (WBIOTECH)
- Katedra Anatomii i Histologii Zwierząt (WMW)
- Katedra Architektury Krajobrazu [03.2019-...] (WO)
- Katedra Biochemii (WMW)
- Katedra Biochemii i Chemii Żywności (WBIOTECH)
- Katedra Biochemii i Toksykologii (WNoZiB)
- Katedra Biofizyki (WBŚ)
- Katedra Biofizyki [03.2019-31.08.2019] (WIP)
- Katedra Biologicznych Podstaw Technologii Żywności i Pasz (WIP)
- Katedra Biotechnologii, Mikrobiologii i Żywienia Człowieka (WBIOTECH)
- Katedra Botaniki [01.2007-02.2019] (WO)
- Katedra Botaniki i Fizjologii Roślin (WBŚ)
- Katedra Chemii (WBIOTECH)
- Katedra Chemii Rolnej i Środowiskowej (WA)
- Katedra Ekofizjologii Bezkręgowców i Biologii Eksperymentalnej (WBŚ)
- Katedra Ekonomii i Agrobiznesu (WA)
- Katedra Eksploatacji Maszyn i Zarządzania Procesami Produkcyjnymi (WIP)
- Katedra Energetyki i Środków Transportu (WIP)
- Katedra Epizootiologii i Klinika Chorób Zakaźnych (WMW)
- Katedra Etologii Zwierząt i Łowiectwa (WNoZiB)
- Katedra Farmakologii, Toksykologii i Ochrony Środowiska (WMW)
- Katedra Fizjologii Roślin [01.2007-02.2019] (WO)
- Katedra Fizjologii Zwierząt (WMW)
- Katedra Fizyki [01.2007-02.2019] (WIP)
- Katedra Geodezji i Informacji Przestrzennej (WIP)
- Katedra Herbologii i Technik Uprawy Roślin (WA)
- Katedra Higieny Zwierząt i Zagrożeń Środowiska (WNoZiB)
- Katedra Higieny Żywności Zwierzęcego Pochodzenia (WMW)
- Katedra Hodowli i Ochrony Zasobów Genetycznych Bydła [06.2021- ] (WNoZiB)
- Katedra Hodowli i Użytkowania Koni (WNoZiB)
- Katedra Hodowli i Użytkowania Zwierząt (WB)
- Katedra Hodowli Zwierząt i Doradztwa Rolniczego (WNoZiB)
- Katedra Hydrobiologii i Ochrony Ekosystemów (WBŚ)
- Katedra i Klinika Chirurgii Zwierząt (WMW)
- Katedra i Klinika Chorób Wewnętrznych Zwierząt (WMW)
- Katedra i Klinika Rozrodu Zwierząt (WMW)
- Katedra Inżynierii i Maszyn Spożywczych (WIP)
- Katedra Inżynierii i Technologii Zbóż [09.2024...] (WBIOTECH)
- Katedra Inżynierii Mechanicznej i Automatyki (WIP)
- Katedra Inżynierii Środowiska (WIP)
- Katedra Inżynierii Środowiska i Geodezji (WIP)
- Katedra Łąkarstwa i Kształtowania Krajobrazu (WA)
- Katedra Maszyn Rolniczych, Leśnych i Transportowych (WIP)
- Katedra Mikrobiologii Środowiskowej (WA)
- Katedra Oceny Jakości i Przetwórstwa Produktów Zwierzęcych (WNoZiB)
- Katedra Ochrony Roślin (WO)
- Katedra Parazytologii i Chorób Ryb (WMW)
- Katedra Patomorfologii i Weterynarii Sądowej (WMW)
- Katedra Podstaw Techniki (WIP)
- Katedra Prewencji Weterynaryjnej i Chorób Ptaków (WMW)
- Katedra Produkcji Roślinnej i Agrobiznesu (WB)
- Katedra Projektowania i Konserwacji Krajobrazu [09.2012-02.2019] (WO)
- Katedra Przedklinicznych Nauk Weterynaryjnych (WMW)
- Katedra Roślin Ozdobnych, Dendrologii i Architektury Krajobrazu [09.2017-02.2019] (WO)
- Katedra Roślin Przemysłowych i Leczniczych (WA)
- Katedra Sadownictwa i Szkółkarstwa [09.2017-02.2019] (WO)
- Katedra Techniki Cieplnej i Inżynierii Procesowej (WIP)
- Katedra Technologii Produkcji Roślinnej i Towaroznawstwa (WA)
- Katedra Technologii Żywności Pochodzenia Roślinnego i Gastronomii (WBIOTECH)
- Katedra Technologii Żywności Pochodzenia Zwierzęcego (WBIOTECH)
- Katedra Turystyki i Rekreacji (WA)
- Katedra Uprawy i Żywienia Roślin [09.2017-02.2019] (WO)
- Katedra Warzywnictwa i Roślin Leczniczych [01.2007-02.2019] (WO)
- Katedra Warzywnictwa i Zielarstwa [03.2019-...] (WO)
- Katedra Zarządzania i Marketingu (WA)
- Katedra Zastosowań Matematyki i Informatyki (WIP)
- Katedra Zoologii i Ekologii Zwierząt (WBŚ)
- Obca Jednostka (O)
- Organizacje Społeczne (JO)
- Wydawnictwo Uniwersytetu Przyrodniczego (JO)
- Zakład Biochemii i Chemii Środowiskowej (WB)
- Zakład Biologii Roślin (WB)
- Zakład Hodowli i Użytkowania Zwierząt (WB)
- Zakład Ochrony i Kształtowania Środowiska (WB)