Polimorfizm długości fragmentów restrykcyjnych mitochondrialnego DNA u sarny (Capreolus capreolus) (Restriction fragment length polymorphism of the mitochondrial DNA in roe deer (Capreolus capreolus))
Opis bibliograficzny
Szczegóły publikacji
Streszczenia
Celem badań było oszacowanie parametrów genetycznych dwóch subpopulacji saren (Capreolus capreolus), na podstawie polimorfizmu długości fragmentów restrykcyjnych mitochondrialnego genu oksydoreduktazy cytochromowej b. Materiałem do badań było DNA z wycinków mięśni pobieranych z dwóch populacji sarny (Capreolus capreolus) pochodzących z Nadleśnictwa Białobrzegi i Zwierzyniec. W celu określenia różnic genetycznych pomiędzy dwoma populacjami wykonano reakcję PCR z użyciem starterów L14735, H15149 i porównano sekwencje nukleotydów uzyskanych amplikonów o długości 464 par zasad. Jednocześnie prze-prowadzono analizę statystyczną fragmentów restrykcyjnych (RFLP) dla trzech loci, wykorzystu-jąc endonukleazy HaeIII, HincII, SspI w obu badanych populacjach dzikich przeżuwaczy. Na podstawie frekwencji alleli wyliczono heterozygotyczność H (0,533–0,764), indeks stopnia poli-morfizmu PIC (0,375–0,661) oraz standardowy dystans genetyczny Ds (0,0094). Wykorzystując sekwencje nukleotydów, stworzono drzewo filogenetyczne ilustrujące zróżnicowanie genetyczne w badanych populacjach sarny. Badanie frekwencji alleli uzyskanych w metodą RFLP wykazało, że najbardziej polimorficznym spośród trzech loci wytypowanych do oceny zmienności genetycz-nej sarny jest locus Ssp I.
The aim of this study was to estimate the basic genetic parameters of the studied sub-population of roe dear (Capreolus capreolus) based on restriction fragment length polymorphism of the mitochondrial DNA. The material for the investigation was collected from two populations of roe deer (Capreolus capreolus) coming from The Forest Inspectorate Bialobrzegi and Zwier-zyniec. To determine the genetic differences between these two populations of roe deer the PCR analysis with the primer pair L14735, H15149 was applied and the comparison of nucleotide sequences of the obtained amplikons of 464 pair in length was made. At the same time, the restric-tion fragments (RFLP) were analysed statistically for three loci using endonucleases HaeIII, HinII, SspI in both studied wild ruminant populations. From the allele frequencies the following were estimated: heterozygosity-H (0.533–0.764), polymorphic information content-PIC (0.375–0.661) and standard distance Ds (0.0094). Using the nucleotide sequences there was developed a phy-logenetic tree illustrating genetic diversity within the roe deer populations under investigation. The researches on allele frequencies obtained after the RFLP method proved locus SspI to be the most polymorphic among the three loci selected for genetic variation estimation in roe deer.
Open Access
Linki zewnętrzne
Identyfikatory
Metryki
Eksport cytowania
Wsparcie dla menedżerów bibliografii:
Ta strona wspiera automatyczny import do Zotero, Mendeley i EndNote. Użytkownicy z zainstalowanym rozszerzeniem przeglądarki mogą zapisać tę publikację jednym kliknięciem - ikona pojawi się automatycznie w pasku narzędzi przeglądarki.
Informacje dodatkowe
Rekord utworzony: | 27 marca 2009 11:54 |
---|---|
Ostatnia aktualizacja: | 19 kwietnia 2022 10:06 |