Search for SNP mutations of chosen genes of the hypothalamic-pituitary axis in laying hens.
Opis bibliograficzny
Szczegóły publikacji
Streszczenia
The analyses performed aimed at the detection of possible point mutations in genes from the multi-level neuro-hormonal system, whose products are expressed in various organs of the bird reproductive system. In future, they could be a basis in the search for relations between polymorphism and the level of hatchability traits. The study involved two lines: Rhode Island White (200 individuals) and Rhode Island Red (100 individuals) laying hens. Molecular analyses consisted in preliminary verification of the SNP mutation in selected gene fragments: Insulin-like growth factor 1 (IGF1, exon 3, GeneID: 418090, amplicon length 479 bp) and Progesterone receptor (PGR, intron 6, GeneID: 396198, amplicon length 362 bp). The PCR-RFLP reaction was the second step of the investigations. A point mutation in the 38965 gene nucleotide within exon 3 was detected as a result of the IGFI gene sequencing reaction. The sense mutation involved an adenineto-guanine nucleotide change. In both hen lines, allele A and a mutated allele B with a 50% frequency were identified using the PCR-RFLP method for further analyses. The PGR sequencing reaction revealed a mutation in nucleotide position 34216 in intron 6 of the gene. Here, transition of the adenine to guanine nucleotide occurred. Allele A was identified, after 155 bp and 207 bp fragments had been obtained in the restriction analysis, as well as a mutated 362 bp allele B. Heterozygosity in the study locus was 0.38 for the RIW line and 0.23 for RIR.
Przeprowadzone analizy miały na celu wytypowanie ewentualnych mutacji punkto-wych w genach należących do wielopoziomowego systemu neurohormonalnego, których produkty wykazują ekspresję w różnych organach układu rozrodczego ptaków. W przyszłości mogłyby one stanowić podstawę do poszukiwania powiązania pomiędzy polimorfizmem a poziomem cech wylęgowych. W badaniach wykorzystano dwa rody kur nieśnych Rhode Island White (200 osob-ników) i Rhode Island Red (100 osobnków). Analizy molekularne obejmowały wstępną weryfi-kację mutacji typu SNP w wybranych fragmentach genów: Insulin-like growth factor 1 (IGF1, ekson 3, GeneID: 418090, długość amplikonu 479 pz) oraz Progesterone receptor (PGR, intron 6, GeneID: 396198, długość amplikonu 362 pz). Drugim etapem badań była przeprowadzona reakcja PCR-RFLP. W wyniku reakcji sekwencjonowania genu IGFI wykryto mutację,w38965nukleotydugenu,mieszczącą siw obrębie eksonu 3. Mutacja typu sensownego dotyczy-podstawienia nukleotydu adeninowego na guaninowy. Wykorzystujw dalszych analizach metodę PCR-RFLP, stwierdzono występowanie w obu rasach kur allelu A i zmutowanego allelu B, którego frekwencja przekraczała ponad 50%. Przeprowadzają reakcje sekwencjonowania genu PGR, stwierdzono występowanie mutacji na pozycji 34216 nukleotydu, w intronie 6 genu. W tym przypadku nastąpiła tranzycja nukleotydu adeninowego na guaninowy. Zidentyfikowano allel A, uzyskując po analizie restrykcyjnej fragmenty o długości 155 pz i 207 pz oraz zmutowany allel B o długości 362 pz. Heterozygotyczność w badanym locus wynosiła 0,38 dla rasy RIW i 0,23 dla rasy RIR.
Open Access
Linki zewnętrzne
Identyfikatory
Metryki
Eksport cytowania
Wsparcie dla menedżerów bibliografii:
Ta strona wspiera automatyczny import do Zotero, Mendeley i EndNote. Użytkownicy z zainstalowanym rozszerzeniem przeglądarki mogą zapisać tę publikację jednym kliknięciem - ikona pojawi się automatycznie w pasku narzędzi przeglądarki.
Informacje dodatkowe
Rekord utworzony: | 1 czerwca 2011 10:47 |
---|---|
Ostatnia aktualizacja: | 27 kwietnia 2022 09:59 |