Differentiation of Candida species and Candida rugosa strains with the use of molecular markers in healthy horses.
Opis bibliograficzny
Szczegóły publikacji
Streszczenia
The aim of the study was identification of molecular markers useful in differentiating the species of selected yeast-like fungi on the skin and mucous membranes of horses and in identification of Candida rugosa strains. The study material was smears from horse skin and mucous membranes. The isolates were assayed with the use of API 20C AUX (bioMérieux) biochemical tests. The examinations involved C. lusitaniae, C. parapsilosis and C. rugosa. RAPD-PCR analyses included amplification with the use of 20 arbitrary primers (OPG01-OPG20). Genetic distances between the Candida rugosa strains were estimated by the Popgen32 programme. The RAPD-PCR analysis yielded amplification products of all the markers used in the study. The number of speciesspecific DNA fragments ranged from 0 to 6, depending on the primer. At least two specific DNA fragments were found for each of the studied species in the case of primers OPG04, OPG05, OPG06, OPG09, OPG11 and OPG14, which may indicate the possibility of their use for species identification. The present work is the first attempt to describe genetic differences between Candida rugosa strains sampled from healthy Hucul horses. Four genotypes within the Candida rugosa species, whose frequency ranged from 0.06 to 0.62, were obtained upon combination of DNA profiles of three primers (OPG04, OPG05 and OPG11). The genetic distances identified indicated considerable diversity of the studied strains. The genetic diversity may corroborate different environmental epidemiologic sources of the strains and may be related to their non-pathogenic nature.
Celem pracy było wskazanie markerów genetycznych do różnicowania gatunków wybranych grzybów drożdżopodobnych występujących na skórze i błonach śluzowych koni, jak też rozróżniania ich szczepów w obrębie gatunku Candida rugosa. Materiał do badań stanowiły wymazy ze skóry i błon śluzowych koni. Izolaty oceniano testami biochemicznymi API 20C AU-X. Badaniami objęto: C. lusitaniae, C. parapsilosis i C. rugosa. Analizy RAPD-PCR obejmowały amplifikację z użyciem 20 arbitrary primer (OPG01-OPG20). Odległości genetyczne pomiędzy szczepami Candida rugosa oszacowano przy wykorzystaniu programu Popgen 32. W wyniku prze-prowadzonej analizy RAPD-PCR otrzymano produkty amplifikacji wszystkich użytych w pracy markerów. Liczba gatunkowo specyficznych fragmentów DNA w zależności od markera wahała się od 0 do 6. Minimum dwa specyficzne fragmenty DNA dla każdego z badanych gatunków odnotowano w przypadku markerów: OPG04, OPG05, OPG06, OPG09, OPG11 i OPG14, co może wskazywać na możliwość ich wykorzystania w identyfikacji gatunkowej.Niniejsze opracowanie stanowi pierwszą próbę opisania genetycznych różnic pomiędzy szczepami Candida rugosawystępującymi u zdrowych koni huculskich. Po połączeniu wyników profili DNA trzech markerów (OPG04, OPG05 i OPG11) otrzymano 4 genotypy w obrębie gatunku Candida rugosa, których frekwencja wynosiła od 0,06 do 0,62. Określone odległości genetyczne wskazywały na znaczną odrębność badanych szczepów. Różnorodność genetyczna szczepów moświadczyćow ich różnych środowiskowych źródłach epidemiologicznych i może być związana z ich niechorobotwórczym charakterem.
Open Access
Identyfikatory
Metryki
Eksport cytowania
Wsparcie dla menedżerów bibliografii:
Ta strona wspiera automatyczny import do Zotero, Mendeley i EndNote. Użytkownicy z zainstalowanym rozszerzeniem przeglądarki mogą zapisać tę publikację jednym kliknięciem - ikona pojawi się automatycznie w pasku narzędzi przeglądarki.
Informacje dodatkowe
Rekord utworzony: | 1 marca 2012 12:29 |
---|---|
Ostatnia aktualizacja: | 27 kwietnia 2022 10:19 |