Menu
Skrót klawiszowy: /
Skrót klawiszowy: /

Genome and pangenome analysis of Lactobacillus hilgardii FLUB - A new strain isolated from mead.

Opis bibliograficzny

Genome and pangenome analysis of Lactobacillus hilgardii FLUB - A new strain isolated from mead. [AUT. KORESP.] KLAUDIA GUSTAW, [AUT.] PIOTR KOPER, MAGDALENA POLAK-BERECKA, KAMILA RACHWAŁ, KATARZYNA SKRZYPCZAK, ADAM WAŚKO. Int. J. Mol. Sci. 2021 Vol. 22 Issue 7 Article Number 3780, il., bibliogr., sum. DOI: 10.3390/ijms22073780
Kliknij opis aby skopiować do schowka

Szczegóły publikacji

Źródło:
International Journal of Molecular Sciences 2021 Vol. 22 Issue 7, Article Number 3780
Rok: 2021
Język: Angielski
Charakter formalny: Artykuł w czasopismie
Typ MNiSW/MEiN: praca oryginalna

Streszczenia

The production of mead holds great value for the Polish liquor industry, which is why the bacterium that spoils mead has become an object of concern and scientific interest. This article describes, for the first time, Lactobacillus hilgardii FLUB newly isolated from mead, as a mead spoilage bacteria. Whole genome sequencing of L. hilgardii FLUB revealed a 3 Mbp chromosome and five plasmids, which is the largest reported genome of this species. An extensive phylogenetic analysis and digital DNA-DNA hybridization confirmed the membership of the strain in the L. hilgardii species. The genome of L. hilgardii FLUB encodes 3043 genes, 2871 of which are protein coding sequences, 79 code for RNA, and 93 are pseudogenes. L. hilgardii FLUB possesses three clustered regularly interspaced short palindromic repeats (CRISPR), eight genomic islands (44,155 bp to 6345 bp), and three (two intact and one incomplete) prophage regions. For the first time, the characteristics of the genome of this species were described and a pangenomic analysis was performed. The concept of the pangenome was used not only to establish the genetic repertoire of this species, but primarily to highlight the unique characteristics of L. hilgardii FLUB. The core of the genome of L. hilgardii is centered around genes related to the storage and processing of genetic information, as well as to carbohydrate and amino acid metabolism. Strains with such a genetic constitution can effectively adapt to environmental changes. L. hilgardii FLUB is distinguished by an extensive cluster of metabolic genes, arsenic detoxification genes, and unique surface layer proteins. Variants of MRS broth with ethanol (10–20%), glucose (2–25%), and fructose (2–24%) were prepared to test the strain’s growth preferences using Bioscreen C and the PYTHON script. L. hilgardii FLUB was found to be more resistant than a reference strain to high concentrations of alcohol (18%) and sugars (25%). It exhibited greater preference for fructose than glucose, which suggests it has a fructophilic nature. Comparative genomic analysis supported by experimental research imitating the conditions of alcoholic beverages confirmed the niche specialization of L. hilgardii FLUB to the mead environment.

Open Access

Tryb dostępu: otwarte czasopismo Wersja tekstu: ostateczna wersja opublikowana Licencja: Creative Commons - Uznanie Autorstwa (CC-BY) Czas udostępnienia: w momencie opublikowania

Identyfikatory

BPP ID: (46, 48061) wydawnictwo ciągłe #48061

Metryki

140,00
Punkty MNiSW/MEiN
6,208
Impact Factor

Eksport cytowania

Wsparcie dla menedżerów bibliografii:
Ta strona wspiera automatyczny import do Zotero, Mendeley i EndNote. Użytkownicy z zainstalowanym rozszerzeniem przeglądarki mogą zapisać tę publikację jednym kliknięciem - ikona pojawi się automatycznie w pasku narzędzi przeglądarki.

Informacje dodatkowe

Rekord utworzony:11 kwietnia 2021 21:06
Ostatnia aktualizacja:1 stycznia 2023 23:11

Informacja o ciasteczkach (tych internetowych, nie tych słodkich i chrupiących...)

Ta strona wykorzystuje pliki cookie do poprawy funkcjonalności i analizy ruchu. Możesz zaakceptować wszystkie pliki cookie lub zarządzać swoimi preferencjami prywatności. Nawet, jeżeli nie zgodzisz się na używanie plików cookie na tej stronie, to informację o tym musimy zapamiętać w formie... pliku cookie, zatem jeżeli chcesz zadbać o swoją prywatność w pełni, zapoznaj się z informacjami, jak zupełnie wyłączyć możliwości śledzenia Ciebie w internecie.

✓ Zgadzam się ✗ Nie zgadzam się