Menu
Skrót klawiszowy: /
Skrót klawiszowy: /

Identification of reference genes for gene expression assessment in Avena sativa under biotic stress triggered by Blumeria graminis.

Opis bibliograficzny

Identification of reference genes for gene expression assessment in Avena sativa under biotic stress triggered by Blumeria graminis. [AUT. KORESP.] SYLWIA SOWA, [AUT.] JOANNA TOPOROWSKA, EDYTA PACZOS-GRZĘDA. Sci. Rep. (Nat. Publ. Group) 2024 Vol.14 Article number: 30006, il., bibliogr. sum. DOI: 10.1038/s41598-024-81348-4
Kliknij opis aby skopiować do schowka

Szczegóły publikacji

Źródło:
Scientific Reports 2024 Vol.14, Article number: 30006.
Rok: 2024
Język: Angielski
Charakter formalny: Artykuł w czasopismie
Typ MNiSW/MEiN: praca oryginalna

Streszczenia

pon proper reference genes (RGs) selection. This study aims to examine the expression stability of nine candidate RGs for the Avena sativa – Blumeria graminis experimental setup. B. graminis causes powdery mildew - the most devastating and economically important fungal disease of crops worldwide. RGs were evaluated in Pm3 and Pm4 oat differential lines and the susceptible cultivar Fuchs during compatible and incompatible interactions with different pathotypes of Blumeria graminis f. sp. avenae in six-time points post inoculation. The identification of genes exhibiting high expression stability was done by four algorithms (geNorm, NormFinder, BestKeeper and deltaCt). The results indicated that regardless of the analysed group, two most stable RGs are required for data normalization. The most sufficient RGs combination was HNR (heterogeneous nuclear ribonucleoprotein 27 C) + EIF4A (eukaryotic initiation factor 4 A-3). ARF (ADP-ribosylation factor) could also be pondered as demonstrating high expression stability. These genes can be considered universal candidates for RT-qPCR normalization to study interaction with B. graminis as well as Puccinia coronata and Puccinia graminis, as confirmed by our previous research. The worst candidate for data standardisation was TUA (α- tubulin). To our best knowledge, this is the first report regarding RGs’ selection in this pathosystem. Identified RGs are proper normalisation candidates for gene expression studies in the A. sativa infected by B. graminis as well as other related pathogens.

Open Access

Tryb dostępu: otwarte czasopismo Wersja tekstu: ostateczna wersja opublikowana Licencja: Creative Commons - Uznanie Autorstwa (CC-BY) Czas udostępnienia: w momencie opublikowania

Identyfikatory

BPP ID: (46, 52196) wydawnictwo ciągłe #52196

Metryki

140,00
Punkty MNiSW/MEiN
3,900
Impact Factor
Q1
WoS

Eksport cytowania

Wsparcie dla menedżerów bibliografii:
Ta strona wspiera automatyczny import do Zotero, Mendeley i EndNote. Użytkownicy z zainstalowanym rozszerzeniem przeglądarki mogą zapisać tę publikację jednym kliknięciem - ikona pojawi się automatycznie w pasku narzędzi przeglądarki.

Informacje dodatkowe

Rekord utworzony:7 stycznia 2025 12:48
Ostatnia aktualizacja:7 stycznia 2025 12:48

Informacja o ciasteczkach (tych internetowych, nie tych słodkich i chrupiących...)

Ta strona wykorzystuje pliki cookie do poprawy funkcjonalności i analizy ruchu. Możesz zaakceptować wszystkie pliki cookie lub zarządzać swoimi preferencjami prywatności. Nawet, jeżeli nie zgodzisz się na używanie plików cookie na tej stronie, to informację o tym musimy zapamiętać w formie... pliku cookie, zatem jeżeli chcesz zadbać o swoją prywatność w pełni, zapoznaj się z informacjami, jak zupełnie wyłączyć możliwości śledzenia Ciebie w internecie.

✓ Zgadzam się ✗ Nie zgadzam się