Menu
Skrót klawiszowy: /
Skrót klawiszowy: /

A comprehensive analysis of runs of homozygosity of eleven cattle breeds representing different production types.

Opis bibliograficzny

A comprehensive analysis of runs of homozygosity of eleven cattle breeds representing different production types. [AUT. KORESP.] TOMASZ SZMATOŁA, [AUT.] ARTUR GURGUL, IGOR JASIELCZUK, TOMASZ ZĄBEK, KATARZYNA ROPKA-MOLIK, ZYGMUNT LITWIŃCZUK, MONIKA BUGNO-PONIEWIERSKA. Animals 2019 Vol. 9 Issue12 Article number 1024, il., bibliogr. sum. DOI: 10.3390/ani9121024
Kliknij opis aby skopiować do schowka

Szczegóły publikacji

Źródło:
Animals 2019 Vol. 9 Issue12, Article number 1024
Rok: 2019
Język: Angielski
Charakter formalny: Artykuł w czasopismie
Typ MNiSW/MEiN: praca oryginalna

Streszczenia

In the presented research, BovineSNP50 microarrays (Illumina) were applied to determine runs of homozygosity in the genomes of 11 cattle breeds maintained in Poland. These cattle breeds represent three basic utility types: milk, meat and dual purpose. Analysis of runs of homozygosity allowed the evaluation of the level of autozygosity within each breed in order to calculate the genomic inbreeding coefficient (FROH), as well as to identify regions of the genome with a high frequency of ROH occurrence, which may reflect traces of directional selectin left in their genomes. Visible differences in the length and distribution of runs of homozygosity in the genomes of the analyzed cattle breeds have been observed. The highest mean number and mean sums of lengths of runs of homozygosity were characteristic for Hereford cattle and intermediate for the Holstein-Friesian Black-and-White variety, Holstein-Friesian Red-and-White variety, Simmental, Limousin, Montbeliarde and Charolais breeds. However, lower values were observed for cattle of conserved breeds. Moreover, the selected livestock differed in the level of inbreeding estimated using the FROH coefficient. In regions of the genome with a high frequency of ROH occurrence, which may reflect the impact of directional selection, a number of genes were observed that can be potentially related to the production traits which are under selection pressure for specific production types. The most important detected genes were GHR, MSTN, DGAT1, FABP4, and TRH, with a known influence on the milk and meat traits of the studied cattle breeds.

Open Access

Tryb dostępu: otwarte czasopismo Wersja tekstu: ostateczna wersja opublikowana Licencja: Creative Commons - Uznanie Autorstwa (CC-BY) Czas udostępnienia: w momencie opublikowania

Identyfikatory

BPP ID: (46, 47213) wydawnictwo ciągłe #47213

Metryki

100,00
Punkty MNiSW/MEiN
2,323
Impact Factor

Eksport cytowania

Wsparcie dla menedżerów bibliografii:
Ta strona wspiera automatyczny import do Zotero, Mendeley i EndNote. Użytkownicy z zainstalowanym rozszerzeniem przeglądarki mogą zapisać tę publikację jednym kliknięciem - ikona pojawi się automatycznie w pasku narzędzi przeglądarki.

Informacje dodatkowe

Rekord utworzony:15 września 2020 13:32
Ostatnia aktualizacja:23 czerwca 2021 10:40

Informacja o ciasteczkach (tych internetowych, nie tych słodkich i chrupiących...)

Ta strona wykorzystuje pliki cookie do poprawy funkcjonalności i analizy ruchu. Możesz zaakceptować wszystkie pliki cookie lub zarządzać swoimi preferencjami prywatności. Nawet, jeżeli nie zgodzisz się na używanie plików cookie na tej stronie, to informację o tym musimy zapamiętać w formie... pliku cookie, zatem jeżeli chcesz zadbać o swoją prywatność w pełni, zapoznaj się z informacjami, jak zupełnie wyłączyć możliwości śledzenia Ciebie w internecie.

✓ Zgadzam się ✗ Nie zgadzam się