Cyklosporyna jest silnym lekiem immunosupresyjnym. Od kilku lat znajduje zastosowanie w weterynarii w leczeniu chorób o podłożu immunologicznym. Z uwagi na efekty uboczne przy stosowaniu ogólnym, najlepszym dla niej wskazaniem staje się miejscowe stosowanie w okulistyce małych zwierząt. Lista chorób oczu, w których może być wykorzystywana stale się powiększa i obecnie obejmuje: suche zapalenie spojówki i rogówki, zapalenie skóry powiek kąta przyśrodkowego, naciek limfoplazmocytarny brzegu trzeciej powieki, przewlekłe, powierzchowne zapalenie rogówki owczarków niemieckich, przewlekle, wrzodziejące zapalenie rogówki jamników szorstkowłosych, powirusowe zapalenie rogówki u kotów. Analiza wykonanych badań dotyczących skuteczności cyklosporyny wskazuje na jej wysoką przydatność w leczeniu tych chorób.