Evaluation of the genetic conservatism of particular genes of the respiratory chain in the raccoon dog.
Opis bibliograficzny
Szczegóły publikacji
Streszczenia
The aim of the present study was estimation of diversity of haplotypes of chosen mtDNA genes in the raccoon dog and determination of their conservatism level. The study material included DNA isolated from blood of farm-bred raccoon dogs. The PCR-RFLP reaction was performed for fragments of raccoon dog mitochondrial genes: cytochrome b (cytb) and cytochrome c oxidase subunits I and II (COI, COII). Two endonucleases: HinfI and MspI were used for the restriction analysis of each gene fragment. In each animal group haplotype AA was only observed in the case of cytb gene and COI. The restriction analysis of gene COII revealed presence of three haplotypes. The highest frequency was noted for haplotype BB (0.48). The frequencies of haplotypes AA and AB were 0.32 and 0.20, respectively. The studied mtDNA regions containing fragments of cytb and COI genes were conservative with respect to the occurrence of restriction sites; therefore, they are likely to be used for determination of species affiliation. Due to its variability, gene COII may be useful in genetic lineage reconstruction, phylogeography and identification of demographic changes in various raccoon dog groups.
Przeprowadzone badania miały na celu ocenę różnorodności haplotypów wybranych genów mtDNA jenota oraz ustalenie poziomu ich konserwatyzmu. Materiał do badań stanowiło DNA wyizolowane z krwi jenotów hodowlanych. Reakcję PCR-RFLP przeprowadzono dla frag-mentów genów mitochondrialnych jenota: cytochromu b (cytb) oraz podjednostki I i II cytochro-mu c (COI, COII). Do przeprowadzenia analizy restrykcyjnej każdego z fragmentów genów wyko-rzystano dwie endonukleazy: HinfI i MspI. W badanej grupie zwierząt odnotowano występowanie wyłącznie haplotypu AA w przypadku genu cytb, jak równieżCOI. Analiza restrykcyjna genu COII ujawniła obecność trzech haplotypów. Największą częstość występowania odnotowano w przypadku haplotypu BB (0,48). Frekwencje haplotypu AA i BA wynosiły odpowiednio: 0,32 i 0,20. Badane w pracy regiony mtDNA obejmujące fragmenty genów: cytbi COI były konserwa-tywne pod względem występowania miejsc restrykcyjnych, nie jest więc wykluczone, iż mogą służyć do określania przynależności gatunkowej. Natomiast gen COII, ze względu na odnotowaną zmienność, może być przydatny w odtwarzaniu linii genealogicznych, filogeografii i identyfikacji zmian demograficznych różnych grup jenotów.
Open Access
Linki zewnętrzne
Identyfikatory
Metryki
Eksport cytowania
Wsparcie dla menedżerów bibliografii:
Ta strona wspiera automatyczny import do Zotero, Mendeley i EndNote. Użytkownicy z zainstalowanym rozszerzeniem przeglądarki mogą zapisać tę publikację jednym kliknięciem - ikona pojawi się automatycznie w pasku narzędzi przeglądarki.
Informacje dodatkowe
Rekord utworzony: | 5 stycznia 2011 11:34 |
---|---|
Ostatnia aktualizacja: | 27 kwietnia 2022 13:40 |