Menu
Skrót klawiszowy: /
Skrót klawiszowy: /

Validation of reference genes as an internal control for studying Avena sativaPuccinia coronata interaction by RT-qPCR.

Opis bibliograficzny

Validation of reference genes as an internal control for studying Avena sativaPuccinia coronata interaction by RT-qPCR. [AUT. KORESP.] SYLWIA SOWA, [AUT.] MAGDALENA SOZONIUK, JOANNA TOPOROWSKA, KRZYSZTOF KOWALCZYK, EDYTA PACZOS-GRZĘDA. Sci. Rep. (Nat. Publ. Group) 2022 Vol.12 Article number 14601, il., bibliogr. sum. DOI: 10.1038/s41598-022-18746-z
Kliknij opis aby skopiować do schowka

Szczegóły publikacji

Źródło:
Scientific Reports 2022 Vol.12, Article number 14601
Rok: 2022
Język: Angielski
Charakter formalny: Artykuł w czasopismie
Typ MNiSW/MEiN: praca oryginalna

Streszczenia

In this study we evaluated eleven candidate reference genes in Avena sativa during compatible and incompatible interactions with two different pathotypes of Puccinia coronata f. sp. avenae in six time points post-inoculation. The identification of genes with high expression stability was performed by four algorithms (geNorm, NormFinder, BestKeeper and ΔCt method). The results obtained confirmed that the combination of two genes would be sufficient for reliable normalization of the expression data. In general, the most stable in the tested plant-pathogen system were HNR (heterogeneous nuclear ribonucleoprotein 27C) and EF1A (elongation factor 1-alpha). ARF (ADP-ribosylation factor) and EIF4A (eukaryotic initiation factor 4A-3) could also be considered as exhibiting high expression stability. CYP (cyclophilin) was shown by all assessment methods to be the worst candidate for normalization in this dataset. To date, this is the first report of reference genes selection in A. sativa–P. coronata interaction system. Identified reference genes enable reliable and comprehensive RT-qPCR analysis of oat gene expression in response to crown rust infection. Understanding the molecular mechanisms involved in the host–pathogen interactions may expand knowledge of durable resistance strategies beneficial to modern oat breeding.

Open Access

Tryb dostępu: otwarte czasopismo Wersja tekstu: ostateczna wersja opublikowana Licencja: Creative Commons - Uznanie Autorstwa (CC-BY) Czas udostępnienia: w momencie opublikowania

Identyfikatory

BPP ID: (46, 49793) wydawnictwo ciągłe #49793

Metryki

140,00
Punkty MNiSW/MEiN
4,600
Impact Factor

Eksport cytowania

Wsparcie dla menedżerów bibliografii:
Ta strona wspiera automatyczny import do Zotero, Mendeley i EndNote. Użytkownicy z zainstalowanym rozszerzeniem przeglądarki mogą zapisać tę publikację jednym kliknięciem - ikona pojawi się automatycznie w pasku narzędzi przeglądarki.

Informacje dodatkowe

Rekord utworzony:22 września 2022 22:56
Ostatnia aktualizacja:5 lipca 2023 09:07

Informacja o ciasteczkach (tych internetowych, nie tych słodkich i chrupiących...)

Ta strona wykorzystuje pliki cookie do poprawy funkcjonalności i analizy ruchu. Możesz zaakceptować wszystkie pliki cookie lub zarządzać swoimi preferencjami prywatności. Nawet, jeżeli nie zgodzisz się na używanie plików cookie na tej stronie, to informację o tym musimy zapamiętać w formie... pliku cookie, zatem jeżeli chcesz zadbać o swoją prywatność w pełni, zapoznaj się z informacjami, jak zupełnie wyłączyć możliwości śledzenia Ciebie w internecie.

✓ Zgadzam się ✗ Nie zgadzam się